Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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