Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms