Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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