Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms