Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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