Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms