Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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