Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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