Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms