Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms