Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms