Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms