Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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