Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms