Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms