Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms