Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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