Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms