Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms