Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms