Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ubash3bQ8BGG7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ubash3bQ8BGG7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ubash3bQ8BGG7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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