Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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