Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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