Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms