Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms