Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg2bQ80XK6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg2bQ80XK6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg2bQ80XK6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg2bQ80XK6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg2bQ80XK6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Atg2bQ80XK6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms