Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms