Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Zbed4Q80WQ9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed4Q80WQ9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed4Q80WQ9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed4Q80WQ9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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