Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms