Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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