Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms