Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms