Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms