Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms