Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms