Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtifQ6PEE2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms