Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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