Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274 ms