Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim37Q6PCX9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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