Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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