Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tpm4Q6IRU2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tpm4Q6IRU2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tpm4Q6IRU2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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