Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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