Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VcanQ62059 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms