Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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