Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BcanQ61361 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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BcanQ61361 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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BcanQ61361 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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