Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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JrkQ60976 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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