Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atf3Q60765 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms