Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc5a6Q5U4D8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms