Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psme4Q5SSW2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms