Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms